Hola Óscar,

Muy buena pregunta. Te comento por partes:

Filtraciones tras instalar una ventana

Si la ventana está bien instalada como explico en el curso, es muy poco probable que haya filtraciones. Es más común que ocurra con las claraboyas, pero en ventanas es raro.

Ahora bien, si llegara a entrar agua, la única solución es desmontarla, limpiar bien todo el perímetro, y volver a instalarla con cuidado. No es difícil, pero sí es una faena que lleva tiempo.

Replanteo y posicionamiento de las ventanas

Mi consejo es empezar siempre desde dentro, con la distribución clara: dónde van los muebles, tabiques, la mesa, etc. A partir de ahí:

Marca el eje vertical y el horizontal de la ventana en el interior, alineándolos con el mobiliario (por ejemplo, que quede centrada sobre la mesa).
Haz un taladro desde dentro hacia fuera para transportar esos ejes al exterior.
Ya desde fuera, marca las líneas de corte aprovechando las líneas de la chapa y cuidado con las esquinas curvas: si la ventana tiene esquinas redondeadas, conviene hacer una plantilla para pasarlas bien.

Sobre las alturas y simetría

Aunque te preocupe que una ventana esté un poco más alta que la otra, ten en cuenta que nunca se ven ambos laterales al mismo tiempo, así que no se nota salvo que haya una gran diferencia. Lo importante es que, por dentro, todo tenga sentido visual y funcional.

Espero haberte aclarado las dudas. ¡Ánimo con la instalación y cualquier cosa aquí estoy!